Đại hội Đảng 12 đã bầu Đoàn Chủ tịch gồm 17 thành viên và Đoàn Thư ký với 5 thành viên. Cụ thể như sau:
Đoàn Chủ tịch Đại hội Đảng 12 có 17 đồng chí

Đoàn Chủ tịch Đại hội có các đồng chí Ủy viên Bộ Chính trị Ban Chấp hành Trung ương Đảng khóa XI: Nguyễn Phú Trọng, Trương Tấn Sang, Nguyễn Tấn Dũng, Nguyễn Sinh Hùng, Lê Hồng Anh, Tô Huy Rứa, Ngô Văn Dụ, Đinh Thế Huynh, Tòng Thị Phóng, Nguyễn Xuân Phúc, Nguyễn Thiện Nhân, Nguyễn Thị Kim Ngân, Phùng Quang Thanh, Trần Đại Quang, Phạm Quang Nghị, Lê Thanh Hải và đồng chí Hà Thị Khiết, Bí thư Trung ương Đảng, Trưởng ban Dân vận Trung ương.

Chủ tịch Đoàn Chủ tịch Đại hội 12 là ông Nguyễn Phú Trọng, Tổng Bí thư Ban Chấp hành Trung ương Đảng khóa 11. 


Đoàn thư ký Đại hội Đảng 12 có 5 đồng chí, đồng chí Trần Quốc Vượng, Bí thư Trung ương Đảng, Chánh Văn phòng Trung ương làm trưởng đoàn. 

Bốn đồng chí khác gồm: đồng chí Phạm Minh Chính, Phó trưởng Ban Tổ chức Trung ương; đồng chí Thuận Hữu, Tổng biên tập Báo Nhân Dân; đồng chí Trương Thị Mai, Chủ nhiệm Ủy ban về các vấn đề xã hội của Quốc hội; đồng chí Võ Văn Thưởng, Phó Bí thư thường trực Thành ủy TP.HCM.

Đại hội Đảng 12 có 68 đoàn, gồm 63 đoàn của 63 tỉnh thành. Năm đoàn còn lại là Đoàn Công an, Đoàn Quân đội, Đoàn Khối các cơ quan trung ương, Đoàn Khối doanh nghiệp và Đoàn Đảng bộ ngoài nước gồm 13 đại biểu.

N.K